支所（両津・相川・羽茂）
市民課
- 庶務係
- 住民連絡、防災・防犯、庁舎管理、地域コミュニティ、地域振興、地域審議会、情報通信、選挙など
- 市民生活係
- 戸籍、住民基本台帳、印鑑登録、国民年金、国民健康保険、後期高齢者医療の申請・相談、衛生業務、市税の減免、納税相談、納税証明、市税・使用料等の収納など
- 福祉保健係
- 高齢福祉、障がい者（児）福祉、児童福祉、介護保険の申請、母子手帳・健康手帳の交付、健康診査・各種がん検診・乳幼児健診・予防接種・相談業務等の保健事業の実施、子どもの医療費の申請受付など
産業振興課
- 産業振興係
- 米の生産調整、農業振興、畜産振興、林業振興、水産業振興、地域商工業の振興、観光事業など
- 建設係
- 市営住宅の管理、除雪、道路・橋りょう・河川・港湾・海岸・公園の管理、整備など
- 上下水道係
- 水道・下水道の料金、水道の使用開始・中止・変更の届出受付、上下水道施設の維持管理、合併浄化槽など
行政サービスセンター（佐和田・真野・新穂・畑野・小木・赤泊）
市民生活係
住民連絡、防災・防犯、地域コミュニティ、地域振興、情報通信、選挙、戸籍、住民基本台帳、印鑑登録、国民年金、国民健康保険、後期高齢者医療の申請・相談、衛生業務、市税の減免、納税相談、納税証明、市税・使用料等の収納、高齢福祉、障がい者（児）福祉、児童福祉、介護保険の申請受付、母子手帳・健康手帳の申請受付、子どもの医療費の申請受付、農業、道路補修、市営住宅等の申請書受付、水道・下水道の料金、水道の使用開始・中止・変更の届出受付など